Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPMQ9NSP4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms