Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVN2

RUSC1, RUN and SH3 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1Q9BVN2 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUSC1Q9BVN2 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms