Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms