Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.6 ms