Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms