Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 NPR3-201ENST00000265074 7344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms