Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms