Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFRP1Q8N474 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms