Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B0

CCDC91, Coiled-coil domain-containing protein 91, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC91Q7Z6B0 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC91Q7Z6B0 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms