Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms