Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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LETMD1Q6P1Q0 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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