Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.9 ms