Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms