Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms