Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms