Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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SYCP1Q15431 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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SYCP1Q15431 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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SYCP1Q15431 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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