Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms