Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms