Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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LSAMPQ13449 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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LSAMPQ13449 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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LSAMPQ13449 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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LSAMPQ13449 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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LSAMPQ13449 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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LSAMPQ13449 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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LSAMPQ13449 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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LSAMPQ13449 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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LSAMPQ13449 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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