Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms