Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms