Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PAX8Q06710 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms