Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms