Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CREMQ03060 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CREMQ03060 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CREMQ03060 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CREMQ03060 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CREMQ03060 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CREMQ03060 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CREMQ03060 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CREMQ03060 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CREMQ03060 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CREMQ03060 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CREMQ03060 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CREMQ03060 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CREMQ03060 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CREMQ03060 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CREMQ03060 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CREMQ03060 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CREMQ03060 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CREMQ03060 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CREMQ03060 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CREMQ03060 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CREMQ03060 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CREMQ03060 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CREMQ03060 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CREMQ03060 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CREMQ03060 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CREMQ03060 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CREMQ03060 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CREMQ03060 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CREMQ03060 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CREMQ03060 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CREMQ03060 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CREMQ03060 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CREMQ03060 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CREMQ03060 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CREMQ03060 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms