Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms