Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF6P49848 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF6P49848 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
TAF6P49848 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
TAF6P49848 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF6P49848 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms