Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNA4P43681 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms