Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MLH1P40692 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MLH1P40692 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MLH1P40692 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MLH1P40692 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MLH1P40692 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MLH1P40692 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MLH1P40692 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MLH1P40692 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MLH1P40692 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MLH1P40692 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MLH1P40692 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MLH1P40692 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MLH1P40692 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MLH1P40692 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MLH1P40692 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MLH1P40692 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MLH1P40692 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms