Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEFHP12036 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEFHP12036 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms