Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms