Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3B2A6NCE7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms