Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TRAF6Q9Y4K3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TRAF6Q9Y4K3 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TRAF6Q9Y4K3 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TRAF6Q9Y4K3 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TRAF6Q9Y4K3 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TRAF6Q9Y4K3 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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