Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP8A1Q9Y2Q0 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms