Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms