Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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KLHL13Q9P2N7 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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KLHL13Q9P2N7 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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KLHL13Q9P2N7 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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KLHL13Q9P2N7 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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KLHL13Q9P2N7 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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KLHL13Q9P2N7 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL13Q9P2N7 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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