Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms