Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms