Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms