Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 COL12A1-202ENST00000345356 5886 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 RNF125-201ENST00000217740 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 STRN-201ENST00000263918 8168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 COL8A1-201ENST00000261037 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ZCCHC9-201ENST00000254037 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 PNPLA7-202ENST00000406427 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 VWC2-201ENST00000340652 11299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 GRM4-204ENST00000535756 6670 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 GREB1L-202ENST00000424526 6052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 HDLBP-203ENST00000391975 6372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 VWDE-201ENST00000275358 5260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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