Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYBPQ8N488 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms