Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TPTE2Q6XPS3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms