Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SGO1Q5FBB7 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SGO1Q5FBB7 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SGO1Q5FBB7 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SGO1Q5FBB7 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SGO1Q5FBB7 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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