Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GNAT1-201ENST00000232461 2417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SLC33A1-201ENST00000359479 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 POLR3F-201ENST00000377603 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PAFAH2-202ENST00000374284 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 NDRG4-204ENST00000394282 3626 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGEF10L-203ENST00000375408 3685 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SAMD4B-213ENST00000610417 3664 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SAMD4B-214ENST00000611159 3662 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 C9orf3-203ENST00000375315 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00642-201ENST00000419459 2026 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FAIM2-205ENST00000550890 2094 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms