Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 DNM1P48-201ENST00000419538 439 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 ABCC6P2-201ENST00000526069 590 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms