Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 LARP4B-201ENST00000316157 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ST3GAL5-204ENST00000393808 2236 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ARHGEF10L-203ENST00000375408 3685 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 SLITRK3-201ENST00000241274 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CACNA1C-205ENST00000399591 6535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CACNA1C-206ENST00000399595 6535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AL109976.1-201ENST00000621919 5678 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CALM1-201ENST00000356978 4242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 BACH2-210ENST00000537989 9108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 NRAP-201ENST00000359988 5580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 GRM4-202ENST00000374181 7275 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CASZ1-201ENST00000344008 4405 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CABIN1-203ENST00000398319 7480 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 RIOK3-201ENST00000339486 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 DTL-201ENST00000366991 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 TNS2-204ENST00000546602 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AL391294.1-201ENST00000641352 4068 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ARHGAP30-201ENST00000368013 4394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AK4-201ENST00000327299 6836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 SLC45A2-202ENST00000382102 2723 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 LIMCH1-213ENST00000511496 3439 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 SYTL2-206ENST00000389960 4299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CPNE4-201ENST00000429747 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 LRRCC1-201ENST00000360375 3813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 BCL2L11-206ENST00000393256 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 PCNX2-203ENST00000344698 5348 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 NUTM2A-AS1-208ENST00000446751 2394 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 PNPLA6-203ENST00000450331 4457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 NLRX1-214ENST00000525863 2850 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 NUP62-208ENST00000596217 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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