Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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CYTH1Q15438 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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CYTH1Q15438 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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CYTH1Q15438 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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CYTH1Q15438 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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