Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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SEC23BQ15437 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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SEC23BQ15437 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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