Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX3Q13761 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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