Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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