Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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RAB40BQ12829 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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RAB40BQ12829 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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RAB40BQ12829 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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